2008年09月27日

Cytoscape + Ruby, Python, JavaScript and Groovy


Cytoscapeでは、今後Javaによるプラグイン開発以外にも、スクリプト言語による自動化やプラグイン開発をサポートする予定です。現段階でも、以下のスクリプト言語をサポートしています:

  • Ruby
  • Python
  • JavaScript
  • Groovy

Cytoscape 2.6.1用のプラグインとしていずれも公開していますので、ちょっとした作業の自動化などに使ってみたいと言う方は、ぜひお試しください。以下のサイトにてサンプルなどを公開しています:


Rubyのプラグインには、予めBioRubyも組み込んでありますので、すぐにKEGG API等をCytoscapeのAPIと組み合わせてご利用いただけます。
posted by 大野圭一朗 at 07:57| サンディエゴ 🌁| Comment(0) | TrackBack(0) | ニュース | このブログの読者になる | 更新情報をチェックする

2008年09月20日

Cytoscape 2.6.1リリース

Cytoscape2.6.1をリリースしました。2.6の安定板ですので、全てのユーザーの方にアップグレードを推奨します。


posted by 大野圭一朗 at 05:58| サンディエゴ ☁| Comment(0) | TrackBack(0) | ニュース | このブログの読者になる | 更新情報をチェックする
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